磁力搅拌器工作过程中影响搅拌子工作状态的因素有很多，其中比较重要的一些影响因素如下：
1）搅拌子的形状。一般讲搅拌子与容器底面的接触面积越小越好，因为搅拌子与容器的磨擦小，但要求搅拌子本身的平衡度高；接触面积大对稳定性好，所以两者要平衡考虑。
2）溶液量与搅拌子长度的关系。小容量用小搅拌子，大容量用大搅拌子。
3）容器底部形状。圆底容器对小搅拌子有收敛作用，使其旋转稳定性更好；平底容器由于没有此作用，因而小搅拌子在自转的同时容易发生公转。
4）平底容器底面是否平整。很显然不平整的底面会导致公转现象的发生。
5）磁力搅拌器的内部结构设计。常见的设计是在盘面下放置一块适当大小的磁铁，它对于整个盘面的磁场均匀度有好处，较长搅拌子的旋转稳定性好。我们也注意到有些国产磁力搅拌器是使用了两块距离非常近的小磁铁球，使有限的磁场完全集中在工作盘中心，因此比较适用于小搅拌子稳定运转，但规格偏大的搅拌子则无法正常运转。
6）高温条件对搅拌子的影响。我们目前常用的搅拌子在高温条件下会逐渐退磁，所以使用一段时间后要确认其是否还有足够的磁性。